【完全ガイド】Shopifyでインボイス制度に対応する方法｜請求書発行・税率設定・実務対応まで徹底解説！

はじめに｜インボイス制度とは？Shopifyストアにも必須の理由

2023年10月、日本国内で「インボイス制度（適格請求書等保存方式）」がスタートしました。
これにより、消費税の仕入税額控除を受けるためには、インボイス発行事業者からの購入が条件となりました。

つまり、
✅ Shopifyで販売する事業者も、インボイス対応請求書発行が求められる
✅ BtoB販売はもちろん、BtoC販売でも領収書発行ニーズに対応すべき
という時代になったのです。

この記事では、Shopifyストアでインボイス制度に対応する具体的な設定方法、運用ノウハウ、注意点を、わかりやすく解説します！

Shopifyでインボイス制度に対応する全体像

まず、押さえておくべきポイントは以下です。

インボイス発行事業者番号（登録番号）を請求書に記載する
適正な税率・税額を明示する
取引年月日・取引内容・相手先情報も記載する

これらを満たす請求書（＝インボイス）を発行できる状態にすることが必要です。

Shopifyでインボイス制度に対応する手順【完全版】

ステップ1. インボイス発行事業者登録を行う

まだ登録していない場合、まずは国税庁のサイトから申請を行いましょう。

国税庁「インボイス制度適格請求書発行事業者公表サイト」から登録申請
登録完了後、登録番号（T＋13桁の番号）を取得

注意：
登録完了まで数週間かかる場合があります。早めの対応を！

ステップ2. Shopifyの税設定を確認・修正する

Shopify管理画面 →【設定】→【税金と関税】
日本向け販売設定で、標準税率（10%）と軽減税率（8%）を正しく設定
商品ごとに適用税率を設定（食品、書籍など軽減対象なら8%設定）

【ポイント】
税率設定ミスはインボイス要件不備に直結します。必ず正確に！

ステップ3. 請求書・領収書発行アプリを導入する

Shopify標準機能だけでは、インボイス制度に完全対応できないため、
請求書発行アプリを使って対応します。

おすすめアプリ：

Order Printer Pro（Shopify公式の高機能帳票アプリ）
Fakturera（インボイス制度対応）（日本発アプリ、インボイス対応設計）

これらを使えば、 ✅ 取引情報自動反映
✅ 登録番号自動挿入
✅ 顧客への領収書送付
がスムーズにできます。

ステップ4. 請求書テンプレートに登録番号を記載する

アプリ内でテンプレート編集を行い、

「適格請求書発行事業者登録番号：TXXXXXXXXXXXX」
税率別に合計額・消費税額を明記
取引年月日・取引内容を明示

これらを必ず反映させましょう。

【コツ】
領収書にも「この領収書はインボイス制度に対応しています」と記載すると、顧客に安心感を与えます。

ステップ5. 顧客向けFAQ・案内ページを作成する

購入者向けに、

「当店はインボイス発行事業者です」
「適格請求書が必要な場合、マイページからダウンロード可能」などのFAQを用意しましょう。

これにより、問い合わせ対応コスト削減＋顧客満足度向上が期待できます。

Shopifyでインボイス対応するときの注意点

1. 軽減税率対象商品の管理を厳密に！

食品、新聞、書籍、定期購読コンテンツなどは軽減税率対象（8%）
その他の商品・サービスは標準税率（10%）

税率設定ミスは税務署指摘・追徴課税リスクにつながるので要注意です。

2. 海外販売との切り分けを明確に！

海外向け販売（輸出取引）は原則「消費税免税」となります。
日本国内取引と混同しないように、

海外販売用の税率設定を「0%」に
配送先住所で自動判定できるように設定しましょう。

3. 一定金額以上取引では保存義務あり

法人向けBtoB取引で、

1取引税込5万円以上
の場合、適格請求書保存義務が強化されます。

大口取引では、特に請求書の正確性に注意しましょう。

インボイス制度対応を強化するおすすめアプリ・サービスまとめ

アプリ・サービス名	特徴
Order Printer Pro	多言語・多通貨対応、カスタム自由
Fakturera	日本発インボイス専用アプリ、超簡単設定
Easy Invoice+	クラウド保存・自動送信にも対応

必要に応じて、これらを使い分けるとスムーズに運用できます！

Shopifyインボイス制度対応に関するQ&A

Q. 個人事業主でも対応必要？
→ 課税事業者（売上1,000万円以上）なら必須。免税事業者でも、取引先ニーズ次第では対応を求められることも。

Q. PDF領収書発行だけでも大丈夫？
→ 基本OK。ただし、内容がインボイス要件を満たしているか確認を！

Q. インボイス発行に追加コストはかかる？
→ 無料アプリで対応可能だが、カスタマイズや自動運用には有料アプリ（約10〜30ドル/月）導入がおすすめ。

まとめ｜Shopifyでインボイス制度に確実対応し、信頼されるストアへ！

インボイス制度対応は、
✅ 取引先との信頼構築
✅ 税務リスク回避
✅ BtoB販路拡大
のために、今や必須です。

Shopifyなら、

標準機能＋アプリ導入
テンプレートカスタマイズ
顧客対応フロー整備

これだけで、スムーズにインボイス対応が可能です。

手間に思えるかもしれませんが、
対応すればするほど、ビジネス基盤が強くなる。

あなたのストアも、今日から「インボイス対応完璧！」な安心ショップを目指しましょう！